GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 16:16:07, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Malthinus seriepunctatus genome assembly, chromosome: 3.
OZ004602.1:26169908-26169927
ACTTTGCTGCCCACATCTAATTCATATTGT26169908GCAGAAAGATTGGCTGAAGGTAATTATTTATTTATCAGTATCTACCAGTA
Kwoniella sp. CBS 6097 chromosome 3.
CP143076.1:247696-247715
CATATACCCCAGGCCAAGTCAAATTCCCCA247696CCTTCAGCCAATCTTTCTGCAGGTCCAAGCCCCAGTATCCCCGTGCTAGA
Malthinus seriepunctatus genome assembly, chromosome: 1.
OZ004600.1:85117668-85117687
TAGTGGTAGATACTGATAAATAAATAATTA85117668CCTTCAGCCAATCTTTCTGCACAATATGAATTAGATGTGGGCAGCAAAGT
Malthinus seriepunctatus genome assembly, chromosome: 1.
OZ004600.1:85732087-85732106
TACTGGTAGATACTGATAAATAAATAATTA85732087CCTTCAGCCAATCTTTCTGCACAATATGAATTAGATGTGGGCAGCAAAGT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GCAGAAAGATTGGCTGAAGG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GCAGAAAGATTGGCTGAAGG | format : html | download : | debug : 

0.008 | 0.008 | search_start;
0.341 | 0.332 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GCAGAAAGATTGGCTGAAGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.441 | 0.100 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCTTCAGCCAATCTTTCTGC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.443 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).