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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-03 12:13:35, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

KR 1020040013638-A/5: DNA Marker for the Clubroot Resistant Gene.
DI130676.1:1-23
1GCAGAATTATAACCTGAGCGTGT
Brassica rapa genome, scaffold: A03.
LR031572.1:25553551-25553573
TGGCAGCCTCTTGCAACAGGAGTCTACACA25553551ACACGCTCAGGTTATAATTCTGCAGCTGTTCAGAAGGAAGAAAGAGTCACTAC
Brassica rapa genome assembly, chromosome: A03.
LS974619.2:25681489-25681511
TGGCAGCCTCTTGCAACAGGAGTCTACACA25681489ACACGCTCAGGTTATAATTCTGCAGCTGTTCAGAAGGAAGAAAGAGTCACTAC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GCAGAATTATAACCTGAGCGTGT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GCAGAATTATAACCTGAGCGTGT | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.150 | 0.142 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GCAGAATTATAACCTGAGCGTGT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.235 | 0.085 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ACACGCTCAGGTTATAATTCTGC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.237 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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