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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-03-14 16:10:51, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

sap60e12.y1 Gm-c1087 Glycine max cDNA clone SOYBEAN CLONE ID: Gm-c1087-5207 5' similar to TR:O81849 O81849 HYPOTHETICAL 60.3 KD PROTEIN, mRNA sequence.
BQ611473.1:8-27
ATGACTT8GCAGATGCGGTTACGAATTTTGCTATAACTGTGGAGCAGAGTGGAAGGAC
454GmaGlobSeed295796 Soybean Seeds Containing Globular-Stage Embryos Glycine max cDNA, mRNA sequence.
FK561164.1:144-163
AACTTGCTGAAGGTTGCTATCACATGACTT144GCAGATGCGGTTACGAATTTTGCTATAACTGTGGAGCAGAGTGGAAGGAC
GM89016B1H08.r1 Gm-r1089 Glycine max cDNA clone Gm-r1089-6135 3, mRNA sequence.
CO982753.1:144-163
GTCCTTCCACTCTGCTCCACAGTTATAGCA144AAATTCGTAACCGCATCTGCAAGTCATGTGATAGCAACCTTCAGCAAGTT
GM89024B1C11.r1 Gm-r1089 Glycine max cDNA clone Gm-r1089-8973 3, mRNA sequence.
CO985457.1:297-316
GTCCTTCCACTCTGCTCCACAGTTATAGCA297AAATTCGTAACCGCATCTGCAAGTCATCCTCGTGCCGAATTC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GCAGATGCGGTTACGAATTT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GCAGATGCGGTTACGAATTT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.363 | 0.354 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GCAGATGCGGTTACGAATTT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.554 | 0.191 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AAATTCGTAACCGCATCTGC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.555 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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