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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-12 12:53:59, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Malus hybrid cultivar cultivar SH6 chromosome 11.
CP143368.1:2339394-2339413
CGTCAATGTGCATCACCTCCACCTCGGGCT2339394CTTGGGTTAGCAACTCCTGCCAGGCCTCTCCCTCGGGCCCACTCGGTCTC
Malus sylvestris genome assembly, chromosome: 11.
OU696513.1:2512054-2512073
CGTCAATGTGCATCACCTCCACCTCGGGCT2512054CTTGGGTTAGCAACTCCTGCCAGGCCTCTCCCTCGGGCCCACTCGGTCTC
Malus domestica genome assembly, chromosome: 11.
OU696687.1:2504636-2504655
CGTCAATGTGCATCACCTCCACCTCGGGCT2504636CTTGGGTTAGCAACTCCTGCCAGGCCTCTCCCTCGGGCCCACTCGGTCTC
Malus domestica genome assembly, chromosome: 11.
OU744552.1:2561273-2561292
CGTCAATGTGCATCACCTCCACCTCGGGCT2561273CTTGGGTTAGCAACTCCTGCCAGGCCTCTCCATCGGGCCCACTCGGTCTC
Malus domestica genome assembly, chromosome: 11.
OU744963.1:2595952-2595971
CGTCAATGTGCATCACCTCCACCTCGGGCT2595952CTTGGGTTAGCAACTCCTGCCAGGCCTCTCCCTCGGGCCCACTCGGTCTC
Malus domestica genome assembly, chromosome: 11.
OU745001.1:2560391-2560410
CGTCAATGTGCATCACCTCCACCTCGGGCT2560391CTTGGGTTAGCAACTCCTGCCAGGCCTCTTCCTCGGGCCCACTCGGTCTC
Sutcliffiella horikoshii strain BAT chromosome, complete genome.
CP082918.1:4265989-4266008
GGCTTTCCATTACTAGCCGATGACCCTCAT4265989CTTGGGTTAGCAACTCCTGCAATATGGTATGAAACACACCTTCAATCCCC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GCAGGAGTTGCTAACCCAAG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GCAGGAGTTGCTAACCCAAG | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.351 | 0.342 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GCAGGAGTTGCTAACCCAAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.436 | 0.085 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CTTGGGTTAGCAACTCCTGC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.441 | 0.005 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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