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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 11:27:59, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Felis catus Senzu DNA, chromosome: B1, American Shorthair breed.
AP023155.1:200382229-200382247
CGCCGTGCCTGGAACAGTGCCGGGGCCCCG200382229GCATATGCTCCCATCAGTGCCTGCCGAATGAATGACAGAGCCTTCCCCA
C34109D01EF PostHarvP1 Citrus clementina cDNA clone C34109D01, mRNA sequence.
FC930816.1:15-33
GATAGGCTATTGAT15GCATATGCTCCCATCAGTGACAATGCTGGAGGCATTGCTGAGATGGCAG
Melanotus villosus genome assembly, chromosome: 3.
OY720420.1:73382157-73382175
AGAATTTTTCTTTTTCTTCTTCTTGTCTAG73382157CACTGATGGGAGCATATGCTTGGATAATGTTTAATTTGGTTGCTTATCT
Dioctria rufipes genome assembly, chromosome: 2.
OZ002741.1:40075568-40075586
CAAAATGCCACTAAATTGGGAAGTTTTGCC40075568CACTGATGGGAGCATATGCTGGCTACAGAAGCTAAAGGGCTAACCACAA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GCATATGCTCCCATCAGTG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GCATATGCTCCCATCAGTG | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.391 | 0.382 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GCATATGCTCCCATCAGTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.480 | 0.089 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CACTGATGGGAGCATATGC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.482 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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