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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2025-01-10 01:46:57, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

PP_LBa0048-D01.F PP_LBa Prunus persica genomic 5', genomic survey sequence.
FI955735.1:624-642
TGAAAGGTTGGTGTAGTACATGGAAAGTTG624CCAACATGCTCAGGAATGCATCCCTAACCATTGGAAGTGAGATTGTTTT
Prunus dulcis DNA, pseudomolecule Pd05.
AP019301.1:12094193-12094211
TGAAAGGTTGGTGTGGTACATGGAAAGTTG12094193CCAACATGCTCAGGAATGCATCCCTAACCATTGGAAGTGAGATTGTTTT
Steromphala cineraria genome assembly, chromosome: 3.
OU744722.1:17577059-17577077
GAAAACTACTGGTATCTGATTTGGCAAACT17577059CCAACATGCTCAGGAATGCTTAACAGTGGTATTCTTTTACAATTTAAAG
Steromphala cineraria genome assembly, chromosome: 3.
OU744722.1:17657927-17657945
GAAAGCTACTGGTATCTGATTTGGCAAACT17657927CCAACATGCTCAGGAATGCTAAACAGTGGAATGTTTAACAATTTAAAGT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GCATTCCTGAGCATGTTGG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GCATTCCTGAGCATGTTGG | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.361 | 0.352 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GCATTCCTGAGCATGTTGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.507 | 0.146 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCAACATGCTCAGGAATGC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.510 | 0.003 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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