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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-11 20:56:07, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Arachis hypogaea cultivar Shitouqi chromosome B06.
CP030998.1:36874478-36874497
AAATGATGGGCTCAGCAAGAGCTTCGCGTG36874478GCCACAAACGGCTTGTTAATCGGAGCTCCGTAGCTCAAGTTATGGCTAAA
Arachis ipaensis cultivar K30076 chromosome 06.
CP049897.1:33492451-33492470
AAATGATGGGCTCAGCAAGAGCTTCGCGTG33492451GCCACAAACGGCTTGTTAATCGGAGCTCCGTAGCTCAAGTTATGGCTAAA
Pipistrellus pygmaeus genome assembly, chromosome: 2.
OX465303.1:198634142-198634161
CCCCCACGGTGCGGCTCAGGCGGGTGTGAC198634142ATTAACAAGCCGTTTGTGGCTGAAGGAGGCCTTGGCCTCGGGAGCGAGCA
Arachis hypogaea DNA, clone: AHGS42O24.
DH961687.1:352-371
TTTAGCCATAACTTGAGCTACGGAGCTCCG352ATTAACAAGCCGTTTGTGGCCACGCGAAGCTCTTGCTGAGCCCATCATTT
Arachis hypogaea cultivar Shitouqi chromosome B08.
CP031000.1:30094626-30094645
GGGGGCCATAACTTGAGCTTCGGAGCTCCG30094626ATTAACAAGCCGTTTGTGGCCACGCGAAGCTCTTATCGAACTCTTTGTTT
Arachis ipaensis cultivar K30076 chromosome 08.
CP049899.1:29719812-29719831
GGGGGCCATAACTTGAGCTTCGGAGCTCCG29719812ATTAACAAGCCGTTTGTGGCCACGCGAAGCTCTTATCGAACTCTTTGTTT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GCCACAAACGGCTTGTTAAT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GCCACAAACGGCTTGTTAAT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.365 | 0.356 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GCCACAAACGGCTTGTTAAT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.473 | 0.108 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ATTAACAAGCCGTTTGTGGC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.475 | 0.003 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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