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2025-12-18 18:30:18, GGGenome : DDBJ release 138.0 (Jun, 2025)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Citrullus lanatus cultivar Allsugar chromosome 6.
CP155014.1:21968116-21968135
TTGTTTTCTATTAATTGTAATTTAGCTAGT21968116GCCTTGAACCCACATGCTATCAACATTAGGCTTTGATTTCTTTTTCCCTT
Citrullus lanatus cultivar Charleston Gray chromosome 6.
CP155147.1:22000490-22000509
TTGTTTTCTATTAATTGTAATTTAGCTAGT22000490GCCTTGAACCCACATGCTATCAACATTAGGCTTTGATTTCTTTTTCCCTT
Citrullus lanatus cultivar Calhoun Gray chromosome 6.
CP155158.1:22011819-22011838
TTGTTTTCTATTAATTGTAATTTAGCTAGT22011819GCCTTGAACCCACATGCTATCAACATTAGGCTTTGATTTCTTTTTCCCTT
Citrullus lanatus cultivar PKR6 chromosome 6.
CP155169.1:22142338-22142357
TTGTTTTCTATTAATTGTAATTTAGCTAGT22142338GCCTTGAACCCACATGCTATCAACATTAGGCTTTGATTTCTTTTTCCCTT
Citrullus lanatus cultivar Sugarlee chromosome 6.
CP155180.1:21964400-21964419
TTGTTTTCTATTAATTGTAATTTAGCTAGT21964400GCCTTGAACCCACATGCTATCAACATTAGGCTTTGATTTCTTTTTCCCTT
Citrullus lanatus cultivar ShiHongNo2 chromosome 6.
CP155191.1:21945919-21945938
TTGTTTTCTATTAATTGTAATTTAGCTAGT21945919GCCTTGAACCCACATGCTATCAACATTAGGCTTTGATTTCTTTTTCCCTT
Citrullus lanatus cultivar PI 288522 chromosome 6.
CP155202.1:21779280-21779299
TTGTTTTCTATTAATTGTAATTTAGCTAGT21779280GCCTTGAACCCACATGCTATCAACATTAGGCTTTGATTTCTTTTTCCCTT
Citrullus lanatus cultivar DaBanHongZiGua chromosome 6.
CP155213.1:22201646-22201665
TTGTTTTCTATTAATTGTAATTTAGCTAGT22201646GCCTTGAACCCACATGCTATCAACATTAGGCTTTGATTTCTTTTTCCCTT
Citrullus lanatus cultivar PI 381740 chromosome 6.
CP155224.1:22009637-22009656
TTGTTTTCTATTAATTGTAATTTAGCTAGT22009637GCCTTGAACCCACATGCTATCAACATTAGGCTTTGATTTCTTTTTCCCTT
Citrullus lanatus cultivar SanBaiGua chromosome 6.
CP155235.1:21802625-21802644
TTGTTTTCTATTAATTGTAATTTAGCTAGT21802625GCCTTGAACCCACATGCTATCAACATTAGGCTTTGATTTCTTTTTCCCTT
Citrullus lanatus cultivar PI 254622 chromosome 6.
CP155246.1:22202259-22202278
TTGTTTTCTATTAATTGTAATTTAGCTAGT22202259GCCTTGAACCCACATGCTATCAACATTAGGCTTTGATTTCTTTTTCCCTT
Citrullus lanatus cultivar HeiShanRen chromosome 6.
CP155257.1:21968116-21968135
TTGTTTTCTATTAATTGTAATTTAGCTAGT21968116GCCTTGAACCCACATGCTATCAACATTAGGCTTTGATTTCTTTTTCCCTT
Citrullus lanatus subsp. mucosospermus cultivar PI 595203 chromosome 6.
CP155312.1:21929990-21930009
TTGTTTTCTATTAATTGTAATTTAGCTAGT21929990GCCTTGAACCCACATGCTATCAACATTAGGCTTTGATTTCTTTTTCCCTT
Citrullus lanatus subsp. mucosospermus cultivar PI 532732 chromosome 6.
CP155334.1:21945549-21945568
TTGTTTTCTATTAATTGTAATTTAGCTAGT21945549GCCTTGAACCCACATGCTATCAACATTAGGCTTTGATTTCTTTTTCCCTT
Alisma plantago-aquatica genome assembly, chromosome: 2.
OY856410.1:264798728-264798747
GGAATCACAGACCTTAAACTCTGTTAATGA264798728GCCTTGAACCCACATGCTATGAGACATGGCTTGATACTCAGCTTCAACAC
Citrullus amarus cultivar PI 296341-FR chromosome 6.
CP155268.1:23754549-23754568
AAGGGTAAAAGAAATCAAAGCCTAATGTTG23754549ATAGCATGTGGGTTCAAGGCACTAGCTAAATGACAATTAATAGAAAACAA
Citrullus amarus cultivar PI 189225 chromosome 6.
CP155279.1:23372861-23372880
AAGGGTAAAAGAAATCAAAGCCTAATGTTG23372861ATAGCATGTGGGTTCAAGGCACTAGCTAAATGACAATTAATAGAAAACAA
Citrullus amarus cultivar RCAT 055816 chromosome 6.
CP155290.1:24292592-24292611
AAGGGGAAAAGAAATCAAAGCCTAATGTTG24292592ATAGCATGTGGGTTCAAGGCACTAGCTAAATGACAATTAATAGAAAACAA
Citrullus amarus cultivar PI 271769 chromosome 6.
CP155301.1:24008933-24008952
AAGGGTAAAAGAAATCAAAGCCTAATGTTG24008933ATAGCATGTGGGTTCAAGGCACTAGCTAAATGACAATTAATAGAAAACAA
Citrullus amarus cultivar PI 482276 chromosome 6.
CP155323.1:24181236-24181255
AAGGGTAAAAGAAATCAAAGCCTAATGTTG24181236ATAGCATGTGGGTTCAAGGCACTAGCTAAATGACAATTAATAGAAAACAA
Citrullus naudinianus cultivar PI 596694M chromosome 6.
CP155367.1:23591246-23591265
AAGGGGGAAAGAAATCAAAGCCTAATGTTG23591246ATAGCATGTGGGTTCAAGGCACTAGCTAAATTACAATTAATAGAAAACAA
Alisma plantago-aquatica genome assembly, chromosome: 2.
OY856410.1:424518766-424518785
TTGTTGTGATTATTTCACATGTTGTGGTAC424518766ATAGCATGTGGGTTCAAGGCATAATAAGATGAATGACAAATTAATCAAGT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GCCTTGAACCCACATGCTAT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GCCTTGAACCCACATGCTAT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.146 | 0.137 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50800/match?q=GCCTTGAACCCACATGCTAT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.218 | 0.073 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50800/match?q=ATAGCATGTGGGTTCAAGGC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=35
0.223 | 0.005 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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