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データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-12 17:08:32, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Brassica napus cultivar Xiang5A chromosome 3.
CP123878.1:1135131-1135149
AGGAAAATAGTATGGTAAATGAGGCTGAGA1135131GCGGTAGATGTATGGAGGTGGTGGGACTTATAATCGATTTTAGGAGAAT
Brassica napus genome assembly, chromosome: A03.
HG994357.1:1136410-1136428
AGGAAAATAGTATGGTAAATGAGGCTGAGA1136410GCGGTAGATGTATGGAGGTGGTGGGACTTATAATCGATTTTAGGAGAAT
Brassica rapa genome, scaffold: A03.
LR031572.1:1147520-1147538
AGGAAAATAGTATGGTAAATGAGGCTGAGA1147520GCGGTAGATGTATGGAGGTGGTGGGACTTATAATCGATTTTAGGAGAAT
Brassica rapa genome assembly, chromosome: A03.
LS974619.2:1148388-1148406
AGGAAAATAGTATGGTAAATGAGGCTGAGA1148388GCGGTAGATGTATGGAGGTGGTGGGACTTATAATCGATTTTAGGAGAAT
Lordithon lunulatus genome assembly, chromosome: 3.
OZ012668.1:35275472-35275490
AGTCTCTACTCATGCCTATACTATCTCTAC35275472ACCTCCATACATCTACCGCCTGCAGTCTGGTAGCAGCCTTCTTCGCTTC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GCGGTAGATGTATGGAGGT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GCGGTAGATGTATGGAGGT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.345 | 0.336 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GCGGTAGATGTATGGAGGT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.456 | 0.111 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ACCTCCATACATCTACCGC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=46
0.457 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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