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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-05 21:39:02, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

CGN-15135 Pericarp Coffea canephora cDNA clone cccp27i4 5', mRNA sequence.
DV677673.1:131-151
CTCTCTCTTCTTCTTCTTCTTCAATGAGCA131ATGAGCATTGAGCAGCACCGCTGAATTCTAATTTCCTAGCCTAGCAGTATA
CGN-35542 Leaf Coffea canephora cDNA clone cccl25f7 5', mRNA sequence.
DV691775.1:32-52
TCTCTCTCTTCTTCTTCTTCTCCTATAAAA32ATGAGCATTGAGCAGCACCGCTGAATTCTAATCCCTCAAACTAGCAGTATA
AFP0AAA7YB08FM1 BAC end, cultivar HD200-94 of Coffea canephora, genomic survey sequence.
FO586988.1:487-507
CTCTCTCTTCTTCTTCTTCTTCAATGAGCA487ATGAGCATTGAGCAGCACCGCTGAATTCTAATTTCCCAGCCTAGCAGTATA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GCGGTGCTGCTCAATGCTCAT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GCGGTGCTGCTCAATGCTCAT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.322 | 0.314 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GCGGTGCTGCTCAATGCTCAT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.671 | 0.348 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ATGAGCATTGAGCAGCACCGC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.673 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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