GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 12:48:33, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

TSA: Cannabis sativa PK00067.1_1.CasaPuKu mRNA sequence.
JP449956.1:74-93
GCTTATTAATCACTACTTTCACCAACGTTA74GCTCATAAACCCTTCTCCAATTATACATGGCTTCCAACCAAACATCATCA
Sedimentisphaera cyanobacteriorum strain L21-RPul-D3 chromosome, complete genome.
CP019633.1:928958-928977
CAGACACTTAAACCTTCGGCTCCCAGCCGG928958GCTCATAAACCCTTCTCCAATACCTCTGCGCGTCGGGATTATTGAGGATA
Ziziphus jujuba cultivar Dongzao chromosome 6.
CP134456.1:13751890-13751909
AATAGCAAAAGAGAATTTAATTTCTGCCAA13751890TTGGAGAAGGGTTTATGAGCTATGGGATGAGAGTTCACAATCATGGAATG
Sedimentisphaera salicampi strain ST-PulAB-D4 chromosome, complete genome.
CP021023.1:332371-332390
TATTCTCGATAATCCCGATGCTCAGAGGTA332371TTGGAGAAGGGTTTATGAGCCCGGTTGGGAGCCGAAAGTTTAATCATCTC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GCTCATAAACCCTTCTCCAA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GCTCATAAACCCTTCTCCAA | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.162 | 0.153 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GCTCATAAACCCTTCTCCAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.251 | 0.089 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TTGGAGAAGGGTTTATGAGC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.253 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).