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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 11:28:48, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

rni.06.F15.5 MBra685 cassava lambda zap Manihot esculenta cDNA 5', mRNA sequence.
CK643367.1:52-75
AGCATTCAAGTACTTGAAGGCGATGGCAAG52GCTCCTGGTTCTATTCGCCTCTTCAGTTATGCTGAAGGTTCTCCGCTCGTTAAG
CV02017B2C12.f1 CV02-normalized library Manihot esculenta cDNA clone CV02017B2C12.f1, mRNA sequence.
DV455106.1:99-122
AGCATTCAAGTACTTGAAGGCGATGGCAAG99GCTCCTGGTTCTATTCGCCTCTTCAGTTATGCTGAAGGTTCTCCGCTCGTTAAG
U_SX-090916_plate56n22.b1 Full-length enriched cDNA library of cassava MECU72 Manihot esculenta cDNA, mRNA sequence.
JG974642.1:220-243
AGCATTCAAGTACTTGAAGGCGATGGCAAG220GCTCCTGGTTCTATTCGCCTCTTCAGTTATGCTGAAGGTTCTCCGCTCGTTAAG
U_SX-090916_plate77h12.b1 Full-length enriched cDNA library of cassava MECU72 Manihot esculenta cDNA, mRNA sequence.
JG976184.1:204-227
AGCATTCAAGTACTTGAAGGCGATGGCAAG204GCTCCTGGTTCTATTCGCCTCTTCAGTTATGCTGAAGGTTCTCCGCTCGTTAAG
U_SX-PL011N01_A_plate13m10.b1 Full-length enriched cDNA library of cassava MECU72 Manihot esculenta cDNA, mRNA sequence.
JG977429.1:204-227
AGCATTCAAGTACTTGAAGGCGATGGCAAG204GCTCCTGGTTCTATTCGCCTCTTCAGTTATGCTGAAGGTTCTCCGCTCGTTAAG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GCTCCTGGTTCTATTCGCCTCTTC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GCTCCTGGTTCTATTCGCCTCTTC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.549 | 0.540 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GCTCCTGGTTCTATTCGCCTCTTC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.656 | 0.107 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GAAGAGGCGAATAGAACCAGGAGC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=45
0.656 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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