GGGenome Help | English

データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-03 12:30:27, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Porphyra yezoensis cDNA, clone:PFL020b02_r, 5'end.
AU191687.1:141-160
CCGCGGGGAGCGCTGCCGCGTCGGCGGCGG141GCTCCTTCATGCTTGGCTACCCGCTAGGGGTTGAAGACGCCTCTGGGTCC
Polia nebulosa genome assembly, chromosome: 5.
OX589592.1:18818351-18818370
GACGATCCAAATCAGGTGCCTACACAATGA18818351GCTCCTTCATGCTTGGCTACCTACAAGTATACACTTTATATAATACACTT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GCTCCTTCATGCTTGGCTAC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GCTCCTTCATGCTTGGCTAC | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.152 | 0.143 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GCTCCTTCATGCTTGGCTAC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.215 | 0.063 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GTAGCCAAGCATGAAGGAGC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.215 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).