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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2025-04-03 13:00:36, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Avena sativa genome assembly, chromosome: 7A.
OU342384.1:401376833-401376852
CGGCGACCATAATCCAGCGGCACTGGACCT401376833GCTGGAGGAGGAGTACCATTCACACAAGGGCGATTGGCGCGGTTCGGACA
Avena sativa genome assembly, chromosome: 7.
OV702285.1:404663328-404663347
CGGCGACCATAATCCAGCGGCACTGGACCT404663328GCTGGAGGAGGAGTACCATTCACACAAGGGCGATTGGCGCGGTTCGGACA
Picochlorum sp. SENEW3 chromosome 02.
CP120454.1:539081-539100
TTCTGTTTCCTTTGACTCTCCTGCTGCTGT539081AATGGTACTCCTCCTCCAGCAGCAGATGATGCCTTCTTGTGTTGAACCAC
Aelia acuminata genome assembly, chromosome: 3.
OU426981.1:104032997-104033016
CCTTTTCTACCGCTCTCCGCAGTCGCTGCA104032997AATGGTACTCCTCCTCCAGCTCCTCCTTCATCATCTCCAACTCCCGTGCT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GCTGGAGGAGGAGTACCATT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GCTGGAGGAGGAGTACCATT | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.166 | 0.158 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GCTGGAGGAGGAGTACCATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.267 | 0.101 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AATGGTACTCCTCCTCCAGC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.268 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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