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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 12:51:48, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

KS19017C07 KS19 Capsicum annuum cDNA, mRNA sequence.
GD088905.1:304-323
TTGTGCATTAGACGCACATCATAAATTAAA304AATCTGCCGCTCATAAAAGCGTGGTATTTAAGT
KS19018G07 KS19 Capsicum annuum cDNA, mRNA sequence.
GD089042.1:208-227
TTGTGCATTAGACGCACATCATAAATTAAA208AATCTGCCGCTCATAAAAGCGTGGTATTTAAGT
Capsicum annuum Takanotsume DNA, chromosome 8, sequence.
AP026703.1:114049734-114049753
TTGTGCATTAGACGCACATCATAAATTAAA114049734AATCTGCCGCTCATAAAAGCGTGGTATTTAAGTAGTGAGAAGGTTTAATG
Capsicum annuum cultivar G1-36576 isolate CaT2T chromosome 8.
CP124724.1:127358008-127358027
TTGTGCATTAGACGCACATCATAAATTAAA127358008AATCTGCCGCTCATAAAAGCGTGGTATTTAAGTAGTGAGAAGGTTTAATG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GCTTTTATGAGCGGCAGATT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GCTTTTATGAGCGGCAGATT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.164 | 0.155 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GCTTTTATGAGCGGCAGATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.388 | 0.224 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AATCTGCCGCTCATAAAAGC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.391 | 0.003 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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