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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 15:38:10, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

sf80b07.y1 Gm-c1019 Glycine max cDNA clone GENOME SYSTEMS CLONE ID: Gm-c1019-2414 5', mRNA sequence.
AW277272.1:88-113
TGCAACTGTTTTCTAATTGATTTTCTGGTT88GGAAAGATTCTTGATTTTGTGACTGGATCTATAAAAATATGATTTATATCTGATAT
Glycine max cultivar Williams 82 chromosome 11.
CP126436.1:6071987-6072012
TGCAACTGTTTTCTAATTGATTTTCTGGTT6071987GGAAAGATTCTTGATTTTGTGACTGGATCTATAAAAATATGATTTATATCTGATAT
GM700017A10B3 Gm-r1070 Glycine max cDNA clone Gm-r1070-6581 3', mRNA sequence.
BE822282.1:360-385
ATATCAGATATAAATCATATTTTTATAGAT360CCAGTCACAAAATCAAGAATCTTTCCAACCAGAAAATCAATTANNAAACAGTTGCA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GGAAAGATTCTTGATTTTGTGACTGG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GGAAAGATTCTTGATTTTGTGACTGG | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.177 | 0.168 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGAAAGATTCTTGATTTTGTGACTGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.281 | 0.104 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCAGTCACAAAATCAAGAATCTTTCC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.281 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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