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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2026-03-04 06:48:02, GGGenome : DDBJ release 139.0 (Sep, 2025)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

TSA: Cannabis sativa PK04485.1_1.CasaPuKu mRNA sequence.
JP450128.1:701-720
GTATGTCACTTTTGCAAATCCACCATCATT701GGAACAAGTTCTGATCCCACCAGGTGTTGAGATTTTGGAGAGACATCCTT
Cannabis sativa cultivar ERBxHO40_23 chromosome X.
CP158652.1:1234650-1234669
GTATGTCACTTTTGCAAATCCACCATCATT1234650GGAACAAGTTCTGATCCCACCAGGTGTTGAGATTTTGGAGAGACATCCTT
Loripinus fragilis genome assembly, chromosome: 11.
OZ026524.1:55655967-55655986
ACCTCCAGCTCTCAATGCAACGCTACAGGA55655967GGAACAAGTTCTGATCCCACAGCACCAAATCAGAGTAAGTGATGCGGTGC
Cannabis sativa cultivar ERBxHO40_23 chromosome X.
CP158662.1:83377415-83377434
AAGGATGTCTCTCCAAAATCTCAACACCTG83377415GTGGGATCAGAACTTGTTCCAATGATGGTGGATTTGCAAAAGTGACATAC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GGAACAAGTTCTGATCCCAC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GGAACAAGTTCTGATCCCAC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.408 | 0.399 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50900/match?q=GGAACAAGTTCTGATCCCAC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.658 | 0.250 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50900/match?q=GTGGGATCAGAACTTGTTCC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.659 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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