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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-03-14 20:59:31, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Cyclopterus lumpus genome assembly, chromosome: 5.
OY735152.1:4487450-4487469
GGACGCAAGAAATACTGGAACTTTTGACTC4487450GGCGAGATGAACAACAACAACAACGTTGCATAAATCGTACGGCGCCGCCA
Glossina morsitans morsitans EST, clone GMsg106a06.p1k.
FM979039.1:194-213
TAAAAATGGTAACGGAACTTTTCCCTAATT194GGCGAGATGAACAACAACAACAACAACAACGACAACCACAACAATAAGAA
Raphanus sativus mRNA, clone: RSCS07H02, 5' end sequence.
FY448412.1:31-50
CTCTCTCTCGGGTTCTTGTCGTGCGTATCC31GGCGAGATGAACAACAACAACACAACACTAGTGAAGTTGAAGTGAACAAA
TSA: Raphanus sativus var. sativus RNA, contig: WG3_1438.
FX660134.1:67-86
CTCTCTCTCGGGTTCTTGTCGTGCGTATCC67GGCGAGATGAACAACAACAACACAACACTAGTGAAGTTGAAGTGAACAAA
Trichobilharzia szidati genome assembly, chromosome: 6.
OX235276.1:32870308-32870327
TTCTACGTTGAAACCAGTCAGTGATGTAAT32870308GGCGAGATGAACAACAACAAACATTTTCCATGTAGGTTTTGGCTTTGAAA
Tetanocera ferruginea genome assembly, chromosome: 3.
OY282642.1:85982649-85982668
CGGCCTCCTTGTTTGTAGTTGCTGCTGTTG85982649TTGTTGTTGTTCATCTCGCCTTCCAACTTGCCATCAAGCTGGCTTAACAA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GGCGAGATGAACAACAACAA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GGCGAGATGAACAACAACAA | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.524 | 0.515 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGCGAGATGAACAACAACAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.637 | 0.113 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TTGTTGTTGTTCATCTCGCC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=45
0.638 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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