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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-03 18:34:21, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Vibrio phage 1.049.O._10N.286.54.B5, partial genome.
MG592431.1:16038-16056
GTGCTTGCCAGTAGTAAACGTGCCAGTAAT16038GGCGCTCTTATTGTGCAGCAAGTTAAAATACCAGTGGGTCACGCCATCG
Vibrio phage 1.050.O._10N.286.48.A6, partial genome.
MG592432.1:16299-16317
GTGCTTGCCAGTAGTAAACGTGCCAGTAAT16299GGCGCTCTTATTGTGCAGCAAGTTAAAATACCAGTGGGTCACGCCATCG
Spirometra erinaceieuropaei genome assembly, scaffold: SPER_scaffold0037363.
LN038232.1:6281-6299
GCGCGTCGAACCAGGGCGTATACGGGATTA6281GGCGCTCTTATTGTGCAGCTATCGGAATGTACATAATCTTCGATAGTGT
Andrena dorsata genome assembly, chromosome: 3.
OV815489.1:51797050-51797068
CGAAAACTGTGCCCGTTTCACATGGGTTTT51797050GCTGCACAATAAGAGCGCCCATCAAGTCGGGGGTGTACGGCGGAGAGTT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GGCGCTCTTATTGTGCAGC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GGCGCTCTTATTGTGCAGC | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.178 | 0.169 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGCGCTCTTATTGTGCAGC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.259 | 0.081 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GCTGCACAATAAGAGCGCC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.260 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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