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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-03-25 19:04:32, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Microcaecilia unicolor genome assembly, chromosome: 1.
LR594632.1:528547646-528547665
AATAGGATTAAAGATCATACAGTTTCTTTG528547646GGCTCACACTCATTCTTCCCTATACCCCTTCCCGTGCACTCCGCTCCATG
Vigna angularis mRNA, clone: VES07A06.
HX944728.1:2-21
A2GGCTCACACTCATTCTTCCCTCAACACCAACATCGCCATGAACATGGCGA
Taurulus bubalis genome assembly, chromosome: 5.
OU342715.1:18870354-18870373
ATTTTATTTTGCTAATGAAATGGCCTGCCT18870354GGGAAGAATGAGTGTGAGCCGCTGCACAGCGAGCTGCTGGCACGGTGCTA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GGCTCACACTCATTCTTCCC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GGCTCACACTCATTCTTCCC | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.378 | 0.370 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGCTCACACTCATTCTTCCC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.462 | 0.084 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGGAAGAATGAGTGTGAGCC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.462 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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