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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 12:45:14, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

KS23053C02 KS23 Capsicum annuum cDNA, mRNA sequence.
GD115942.1:7-26
GCACGA7GGCTCCATTTTCCCTCTTTCTTCAATGGCTTCATTTGCTTTTCGAAGCTC
Bemisia tabaci genome assembly, chromosome: 3.
OU963864.1:27778659-27778678
ATAACAATCACCCGTTTCAACCTATGTGAT27778659GGCTCCATTTTCCCTCTTTCTTCTTAGTCTATCAATTTGGACAATCAGAC
Gastracanthus pulcherrimus genome assembly, chromosome: 1.
OX424572.1:209571384-209571403
AATTATAACAATGACTGCTAATAAAATATC209571384GAAAGAGGGAAAATGGAGCCTTCCTCAATGTCATCTTATAATTATCTGTA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GGCTCCATTTTCCCTCTTTC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GGCTCCATTTTCCCTCTTTC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.290 | 0.282 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGCTCCATTTTCCCTCTTTC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.381 | 0.091 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GAAAGAGGGAAAATGGAGCC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.382 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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