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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2025-04-06 05:22:40, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Lotus japonicus B-129 DNA, chromosome 5, complete sequence.
AP022633.1:8861675-8861694
TACCATAACTTATAATTCTTAGTCGCTGGC8861675GGCTGCGCAATAGAGAGATAGAGAGAGACAGACAGAGAGAGAGAGAGAGA
Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 5, clone: LjB17J16, BM1988a.
AP010307.1:89645-89664
TCTCTCTCTCTCTCTCTGTCTGTCTCTCTC89645TATCTCTCTATTGCGCAGCCGCCAGCGACTAAGAATTATAAGTTATGGTA
Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 5, clone: LjB01H03, BM1799.
AP010309.1:58405-58424
TCTCTCTCTCTCTCTCTGTCTGTCTCTCTC58405TATCTCTCTATTGCGCAGCCGCCAGCGACTAAGAATTATAAGTTATGGTA
Watersipora subatra genome assembly, chromosome: 4.
OY755161.1:57341260-57341279
CATGTTGGCCAATGTTTGATAATGAAAATT57341260TATCTCTCTATTGCGCAGCCAATTGTAAACCTTGTCAACATAGAATATAT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GGCTGCGCAATAGAGAGATA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GGCTGCGCAATAGAGAGATA | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.367 | 0.358 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGCTGCGCAATAGAGAGATA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.469 | 0.103 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TATCTCTCTATTGCGCAGCC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.471 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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