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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 13:19:07, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

CGN-4283 Cherry of Early Development Stage Coffea canephora cDNA clone cccs18w7g12 5', mRNA sequence.
DV666417.1:39-65
GAAGAAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCCC39AGTCACAAGTCACAAGAATTCACAGCCCTACGGCCCCCTGCCCAGTGGCCGGTTTGC
CGN-17831 Seed of Middle Development Stage Coffea canephora cDNA clone cccs30w12h2 5', mRNA sequence.
DV679578.1:40-66
AGAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCCC40AGTCACAAGTCACAAGAATTCACAGCCCTACGGCCCCCTGCCCAGTGGCCGGTTTGC
CGN-26465 Seed of Middle Development Stage Coffea canephora cDNA clone cccs30w35i5 5', mRNA sequence.
DV685220.1:90-116
GAAGAAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCCC90AGTCACAAGTCACAAGAATTCACAGCCCTACGGCCCCCTGCCCAGTGGCCGGTTTGC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GGCTGTGAATTCTTGTGACTTGTGACT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GGCTGTGAATTCTTGTGACTTGTGACT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.224 | 0.215 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGCTGTGAATTCTTGTGACTTGTGACT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.442 | 0.219 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AGTCACAAGTCACAAGAATTCACAGCC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.445 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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