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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-15 18:01:03, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

KS07009A09 KS07 Capsicum annuum cDNA, mRNA sequence.
BM065938.1:290-311
GTAGCCAACATTACCAAGTTAGGATTCCTA290GGGAAAGAGAAGCCTTGGGTTGGACGCGGACTTATTCTCGTGCATTCCCTCC
TSA: Capsicum annuum MGMT_Contig34250 mRNA sequence.
JW084494.1:1816-1837
GTAGCCAACATTACCAAGTTAGGATTCCTA1816GGGAAAGAGAAGCCTTGGGTTGGACGCGGACTTATTCTCGTGCATTCCCTCC
TSA: Capsicum annuum CM_MegaContig_9587 mRNA sequence.
JW100394.1:328-349
GGAGGGAATGCACGAGAATAAGTCCGCGTC328CAACCCAAGGCTTCTCTTTCCCTAGGAATCCTAACTTGGTAATGTTGGCTAC
Capsicum annuum Takanotsume DNA, chromosome 10, sequence.
AP026705.1:3331973-3331994
GGAGGGAATGCACGAGAATAAGTCCGCGTC3331973CAACCCAAGGCTTCTCTTTCCCTAGGAATCCTAACTTGGTAATGTTGGCTAC
Capsicum annuum cultivar G1-36576 isolate CaT2T chromosome 10.
CP124722.1:3429664-3429685
GGAGGGAATGCACGAGAATAAGTCCGCGTC3429664CAACCCAAGGCTTCTCTTTCCCTAGGAATCCTAACTTGGTAATGTTGGCTAC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GGGAAAGAGAAGCCTTGGGTTG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GGGAAAGAGAAGCCTTGGGTTG | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.370 | 0.361 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGGAAAGAGAAGCCTTGGGTTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.503 | 0.133 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CAACCCAAGGCTTCTCTTTCCC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.505 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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