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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 12:34:43, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

p293 Porphyra yezoensis in Lambda UniZAP Pyropia yezoensis cDNA clone 293 5' similar to Putative peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mRNA sequence.
AI187693.1:115-133
GCCCGGCCGCCCGCCCCCGACTCCCCTGCC115AGTTCCGTCATCCAATCCCCCTGCCGCCCCGCACCGACCTACCGCCATG
Porphyra yezoensis cDNA, clone:PF033h12_r, 5'end.
AU189064.1:75-93
GCCCGCCCGCCCGCCCCCGACTCCCCTGCC75AGTTCCGTCATCCAATCCCCCTGCCGCCCCCGCACCGACCTACCGCCAT
Porphyra yezoensis cDNA, clone:PFL065d09_r, 5'end.
AU194790.1:87-105
GCCCGCCCGCCCGCCCCCGACTCCCCTGCC87AGTTCCGTCATCCAATCCCCCTGCCGCCCCCGCACCGACCTACCGCCAT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GGGATTGGATGACGGAACT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GGGATTGGATGACGGAACT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.335 | 0.327 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGGATTGGATGACGGAACT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.422 | 0.087 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AGTTCCGTCATCCAATCCC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.424 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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