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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2025-04-08 16:48:08, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 4, clone: LjT04D06, TM0692.
AP007520.2:62705-62724
ACCCCCCTCAGCTTCAACCCATCTTGGCTA62705GGGATTTGTTAGGCTTGTAGTCTTTTCTGTTTTGTTTTTAATTTTCCGAT
Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 3, clone: LjT40L13, TM0110a.
AP006071.1:71181-71200
CACCTCAAGAGCTTTCTCTCATTTTGGCTA71181GGGATTTGTTAGGCTTGTAGTTTTTCTTTTGTTGATTTTAATTTTCCGAT
Lotus japonicus B-129 DNA, chromosome 4, complete sequence.
AP022632.1:8142903-8142922
ACCCCCCTCAGCTTCAACCCATCTTGGCTA8142903GGGATTTGTTAGGCTTGTAGTCTTTTCTGTTTTGTTTTTAATTTTCCGAT
Lotus japonicus B-129 DNA, chromosome 5, complete sequence.
AP022633.1:25112557-25112576
CACCTCAAGAGCTTTCTCTCATTTTGGCTA25112557GGGATTTGTTAGGCTTGTAGTTTTTCTTTTGTTGATTTTAATTTTCCGAT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GGGATTTGTTAGGCTTGTAG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GGGATTTGTTAGGCTTGTAG | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.340 | 0.332 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGGATTTGTTAGGCTTGTAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.434 | 0.094 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CTACAAGCCTAACAAATCCC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=46
0.434 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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