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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 16:16:04, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Nannobrachium achirus genome assembly, chromosome: 21.
OY997658.1:30336041-30336060
TTGGTTCCCTTTGTACACTGTCAGAGTTAT30336041GGGTCAATTTAGCTCTGGTGCGATTTGGAACGCACGCAGTGGAATCCACT
Spinacia oleracea subsp. turkestanica cultivar PI494751 chromosome X.
CP130739.1:179700301-179700320
CCCAACACATAGTCCCAATGGATCTCTCAA179700301CACCAGAGCTAAATTGACCCAAGTGGAACTGGATCTGAACAAACAGTATT
Spinacia oleracea subsp. turkestanica cultivar PI494751 chromosome Y.
CP130887.1:183188991-183189010
CCCAACACATAGTCCCAATGGATCTCTCAA183188991CACCAGAGCTAAATTGACCCAAGTGGAACTGGATCTGAACAAACAGTATT
Elegia similella genome assembly, chromosome: 21.
OX383946.1:9110122-9110141
TACTACTTAAAAAGTGCTCGAGCATTTTTC9110122CACCAGAGCTAAATTGACCCTTAGTTTGCAAACTGTTCTGGTCTTCCACT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GGGTCAATTTAGCTCTGGTG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GGGTCAATTTAGCTCTGGTG | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.350 | 0.341 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGGTCAATTTAGCTCTGGTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.450 | 0.100 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CACCAGAGCTAAATTGACCC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.452 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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