GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-06 15:27:54, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Lotus japonicus B-129 DNA, chromosome 2, complete sequence.
AP022630.1:76275800-76275820
ACAGGATTTTTTTTTTAAGAACAACACATA76275800GGGTTAGTTGCATTTTATGTCTCGTTTTTTTCTTTGCTTGGTGTCTTGTTC
Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 2, clone: LjT48O14, TM0467.
AP007374.2:54464-54484
GAACAAGACACCAAGCAAAGAAAAAAACGA54464GACATAAAATGCAACTAACCCTATGTGTTGTTCTTAAAAAAAAAATCCTGT
Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 2, clone: LjB24P14, BM1721.
AP010344.1:60972-60992
GAACAAGACACCAAGCAAAGAAAAAAACGA60972GACATAAAATGCAACTAACCCTATGTGTTGTTCTTAAAAAAAAAATCCTGT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GGGTTAGTTGCATTTTATGTC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GGGTTAGTTGCATTTTATGTC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.100 | 0.092 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGGTTAGTTGCATTTTATGTC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.125 | 0.024 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GACATAAAATGCAACTAACCC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.126 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).