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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 11:27:59, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

38RDBRM_UP_020_A06_01APR2004_048 Brassica rapa 38RDBRM Brassica rapa cDNA 5', mRNA sequence.
CX267273.1:1-22
1GGTCCTATCTTCACGTCCTTCAAATCTTGATTCACTCTCCAAATCTTCTCTT
37RDBRH_UP_089_C03_23JAN2006_027 Brassica rapa 37RDBRH Brassica rapa cDNA 5', mRNA sequence.
ES932779.1:1-22
1GGTCCTATCTTCACGTCCTTCAAATCTTGATTCACTCTCCAAATCTTCTCTT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GGTCCTATCTTCACGTCCTTCA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GGTCCTATCTTCACGTCCTTCA | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.253 | 0.244 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGTCCTATCTTCACGTCCTTCA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.353 | 0.101 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGAAGGACGTGAAGATAGGACC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.353 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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