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データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-03-15 16:53:07, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Trifolium fragiferum genome assembly, chromosome: 2.
OX940790.1:15670841-15670860
GGATTTGAAGGATTCCATACCAATCAGTGT15670841GGTGATCGTTGATTCTCGCTTCTCCGGCGAGGAGAGTGTCGATTACAGCA
Trifolium repens mRNA, clone: WCC28f17_068, unspecified EST.
FY463920.1:242-261
AAGCTCCTTAGACACTCTCCTAGCCGGAGA242AGCGAGAATCAACGATCACCACACCGATTAGTATGGAATCCTTCAAATCC
Trifolium repens isolate ACLI19 chromosome 04_Occ.
CP125842.1:47869772-47869791
AAGCTCCTTAGACACTCTCCTCGCCGGAGA47869772AGCGAGAATCAACGATCACCACAACGATTAGTATGGAATCCTTCAAATCC
Trifolium repens isolate ACLI19 chromosome 04_Pall.
CP125843.1:44309748-44309767
AAGCTCCTTAGACACTCTCCTCGCCGGAGA44309748AGCGAGAATCAACGATCACCACACCGATTAGTATGGAATCCTTGAAATCC
Trifolium repens isolate ACLI19 chromosome 08_0cc.
CP125850.1:13286763-13286782
TGCTGTAATCGACACTCTCCTCGCCGGAGA13286763AGCGAGAATCAACGATCACCACACCGATTGGTATGGAATTCTTCAAATCC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GGTGATCGTTGATTCTCGCT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GGTGATCGTTGATTCTCGCT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.107 | 0.098 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGTGATCGTTGATTCTCGCT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.225 | 0.118 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AGCGAGAATCAACGATCACC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.228 | 0.003 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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