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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-05 20:06:05, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Porphyra yezoensis cDNA, clone:PFL037a10_r, 5'end.
AU192871.1:86-105
ACCCCCCCCCGGCGCCGTACGGCGTGCGGG86GGTGCTCTCGTCTTGATTCCTTTCTTCACTTTCCTAGTCCATCTCTTGGG
Porphyra yezoensis cDNA, clone:PFL051h12_r, 5'end.
AU193867.1:122-141
ACCCCCCCCCGGCGCCGTACGGCGTGCGGG122GGTGCTCTCGTCTTGATTCCTTTCTTCACTTTCCTAGTCCATCTCTTGGG
Siphonodentalium dalli isolate Sc116.8C chromosome V.
CP136065.1:148053274-148053293
ACTTACAATCCTGGTGAGAACATTTCCTAT148053274GGTGCTCTCGTCTTGATTCCAGTATTGCCACACGTTATCCAAGAAGTCCA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GGTGCTCTCGTCTTGATTCC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GGTGCTCTCGTCTTGATTCC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.352 | 0.344 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGTGCTCTCGTCTTGATTCC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.449 | 0.097 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGAATCAAGACGAGAGCACC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.449 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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