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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-05 18:53:05, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

CSATR1JP-T3-026_L08_19DEC2008_022 CSATR1JP Cannabis sativa cDNA, mRNA sequence.
JK497676.1:425-444
TGGGGAGGTGGAGTACGGGGAAGATGAGAA425GTTTAGCATTTTGGGACACCCTATGTGTTTGAAGAGGGCGAGAGATGGGT
TSA: Cannabis sativa PK11736.1_1.CasaPuKu mRNA sequence.
JP449800.1:413-432
TGGGGAGGTGGAGTACGGGGAAGATGAGAA413GTTTAGCATTTTGGGACACCCTATGTGTTTGAAGAGGGCGAGAGATGGGT
TSA: Cannabis sativa PK11736.2_1.CasaPuKu mRNA sequence.
JP479002.1:119-138
TGGGGAGGTGGAGTACGGGGAAGATGAGAA119GTTTAGCATTTTGGGACACCCTATGTGTTTGAAGAGGGCGAGAGATGGGT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GGTGTCCCAAAATGCTAAAC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GGTGTCCCAAAATGCTAAAC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.384 | 0.375 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGTGTCCCAAAATGCTAAAC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.616 | 0.232 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GTTTAGCATTTTGGGACACC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.619 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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