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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 13:03:51, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

TSA: Cannabis sativa PK09364.1_1.CasaPuKu mRNA sequence.
JP449719.1:18-37
ACGGCCTAGTTACGGGG18GGTGTTGTGTTGTTATGGCATCAAACGTTAAGTATTTTCAAAGCCTTGGC
Xestia ashworthii genome assembly, chromosome: 5.
OX465552.1:9677531-9677550
TTATAGTGTACCTACGTAAGCCATGTTGTT9677531GGTGTTGTGTTGTTATGGCATTCGCCCAATACTACGTCGCACTTCGGAAT
Ochropleura plecta genome assembly, chromosome: 26.
FR997748.1:10782316-10782335
GAGGGGTGTTCATATCCGCCAGTCGGCCAT10782316TGCCATAACAACACAACACCCCTCTCGCGTACCTACCTACCTACCTCAGG
Sturmia bella genome assembly, chromosome: 5.
OY759172.1:30560187-30560206
TCATAATTCTGTTTTGTTAATTTAAGTTTA30560187TGCCATAACAACACAACACCTAGAAAATATTCGCCTGAGAAATTGAAAAC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GGTGTTGTGTTGTTATGGCA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GGTGTTGTGTTGTTATGGCA | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.188 | 0.179 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGTGTTGTGTTGTTATGGCA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.270 | 0.082 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGCCATAACAACACAACACC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.272 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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