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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-03 20:01:27, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Malus hybrid cultivar cultivar SH6 chromosome 15.
CP143389.1:37382222-37382246
TTGTGATTCTTGGTGTCTTACTATATTAGT37382222GGTGTTTTGTTCCCTTTTTAATTCCTTCAACATTTGGTCTATTTTTTCACTAGTA
Malus sylvestris genome assembly, chromosome: 15.
OU696517.1:34945052-34945076
TACTTGTGAAAAAATAGACCAAATGTTGAA34945052GGAATTAAAAAGGGAACAAAACACCATTAATGTAGTAAGACACCAAGAATCACAA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GGTGTTTTGTTCCCTTTTTAATTCC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GGTGTTTTGTTCCCTTTTTAATTCC | format : html | download : | debug :

0.008 | 0.008 | search_start;
0.186 | 0.177 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGTGTTTTGTTCCCTTTTTAATTCC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.310 | 0.125 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGAATTAAAAAGGGAACAAAACACC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.311 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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