GGGenome Help | English

データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-03 12:43:49, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Dianthus caryophyllus mRNA, clone: CES04G14, 5' end sequence.
FY383759.1:371-390
GTGACACCTTAATTACCACCACCATGATCA371GGTTCATTTCACGTCTTGCCGCTAAAAGAAATATTTCGTTGTTGTTGTTG
TSA: Dianthus caryophyllus mRNA, contig: CAK09.339.C1.
FX297143.1:370-389
GTGACACCTTAATTACCACCACCATGATCA370GGTTCATTTCACGTCTTGCCGCTAAAAGAAATATTTCGTTGTTGTTGTTG
TSA: Dianthus caryophyllus mRNA, contig: CAK09.339.C2.
FX297144.1:346-365
CAACAACAACAACGAAATATTTCTTTTAGC346GGCAAGACGTGAAATGAACCTGATCATGGTGGTGGACTGGTGGTAATTAA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GGTTCATTTCACGTCTTGCC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GGTTCATTTCACGTCTTGCC | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.255 | 0.246 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGTTCATTTCACGTCTTGCC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.336 | 0.082 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGCAAGACGTGAAATGAACC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.337 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).