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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2026-03-04 05:50:34, GGGenome : DDBJ release 139.0 (Sep, 2025)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Dianthus caryophyllus mRNA, clone: CES04G14, 5' end sequence.
FY383759.1:371-390
GTGACACCTTAATTACCACCACCATGATCA371GGTTCATTTCACGTCTTGCCGCTAAAAGAAATATTTCGTTGTTGTTGTTG
TSA: Dianthus caryophyllus mRNA, contig: CAK09.339.C1.
FX297143.1:370-389
GTGACACCTTAATTACCACCACCATGATCA370GGTTCATTTCACGTCTTGCCGCTAAAAGAAATATTTCGTTGTTGTTGTTG
Cyphastrea salae genome assembly, chromosome: 10.
OZ077372.1:3873114-3873133
TACTCTTAAGTCTAACGGAAAAAAGCACAT3873114GGTTCATTTCACGTCTTGCCGAACGATATGAGAGAACTTGAACGAAACTA
TSA: Dianthus caryophyllus mRNA, contig: CAK09.339.C2.
FX297144.1:346-365
CAACAACAACAACGAAATATTTCTTTTAGC346GGCAAGACGTGAAATGAACCTGATCATGGTGGTGGACTGGTGGTAATTAA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GGTTCATTTCACGTCTTGCC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GGTTCATTTCACGTCTTGCC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.513 | 0.504 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50900/match?q=GGTTCATTTCACGTCTTGCC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.787 | 0.274 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50900/match?q=GGCAAGACGTGAAATGAACC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.788 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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