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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-08 09:21:31, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 5, clone: LjT09M14, TM1662.
AP008202.2:25667-25688
AAACTCAAAACTTTATTTAAAAGAAATTAA25667GAATGTACGACTTAAACCAACCAACAATCTCTTTTTGTTGGTGTATCATTTT
Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 5, clone: LjT33L13, TM0327.
AP006430.1:41856-41877
AAACTCAAAACTTTATTTAAAAGAAATTAA41856GAATGTACGACTTAAACCAACCAACAATCTCTTTTTGTTGGTGTATCATTTT
Lotus japonicus B-129 DNA, chromosome 5, complete sequence.
AP022633.1:64377139-64377160
GAACTCAAAACTTTATTTAAAAGAAATTAA64377139GAATGTACGACTTAAACCAACCAACAATCTCTTTTTGTTGGTGTATCATTTT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GGTTGGTTTAAGTCGTACATTC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GGTTGGTTTAAGTCGTACATTC | format : html | download : | debug :

0.008 | 0.008 | search_start;
0.109 | 0.101 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGTTGGTTTAAGTCGTACATTC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.147 | 0.038 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GAATGTACGACTTAAACCAACC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.149 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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