GGGenome Help | English

データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-08 19:25:27, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 2, clone: LjT44L24, TM0413.
AP009967.1:94678-94697
GTTCGCGACCTTTGTATTGTCACCGGAGTT94678GGTTGGTTTGTATTGCGTGCTTAAGCGTTTTGCTCTGAAGCCTTTTGATA
Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 5, clone: LjT02M03, TM0034a.
AP004503.1:28100-28119
GTGTGTTTTTAGGTTTTTACTGTCGGTGTT28100GGTTGGTTTGTATTGCGTGCTTAAGAGTTTGCTTTCAAGCCTTTTGATAT
Lotus japonicus B-129 DNA, chromosome 5, complete sequence.
AP022633.1:7623968-7623987
GTGTGTTTTTAGGTTTTTACTGTCGGTGTT7623968GGTTGGTTTGTATTGCGTGCTTAAGAGTTTGCTTTCAAGCCTTTTGATAT
Lotus japonicus DNA, clone:LjT18b12_not.
AG246037.1:147-166
ATATCAAAAGGCTTGAAAGCAAACTCTTAA147GCACGCAATACAAACCAACCAACACCGACAGTAAAAACCTAAAAACACAC
Lotus japonicus B-129 DNA, chromosome 2, complete sequence.
AP022630.1:19876242-19876261
TATCAAAAGGCTTCAGAGCAAAACGCTTAA19876242GCACGCAATACAAACCAACCAACTCCGGTGACAATACAAAGGTCGCGAAC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GGTTGGTTTGTATTGCGTGC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GGTTGGTTTGTATTGCGTGC | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.358 | 0.349 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGTTGGTTTGTATTGCGTGC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.453 | 0.095 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GCACGCAATACAAACCAACC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.454 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).