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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-08 03:46:38, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

KS19063C04 KS19 Capsicum annuum cDNA, mRNA sequence.
GD093112.1:326-348
GTTTCAGCAAGTGTAGTAAGGATGGTAGTG326GTAACTCTCCCCTTCCATTGTAGATTTCAGTTTCATCCCCCACATTTCCTCCC
TSA: Capsicum annuum MGMT_Contig2292, mRNA sequence.
JW052536.1:1872-1894
GTTTCAGCAAGTGTAGTAAGGATGGTAGTG1872GTAACTCTCCCCTTCCATTGTAGATTTCAGTTTCATCCCCCACATTTCCTCCC
Capsicum annuum Takanotsume DNA, chromosome 10, sequence.
AP026705.1:236972155-236972177
GGGAGGAAATGTGGGGGATGAAACTGAAAT236972155CTACAATGGAAGGGGAGAGTTACCACTACCATCCTTACTACACTTGCTGAAAC
Capsicum annuum cultivar G1-36576 isolate CaT2T chromosome 10.
CP124722.1:241489914-241489936
GGGAGGAAATGTGGGGGATGAAACTGAAAT241489914CTACAATGGAAGGGGAGAGTTACCACTACCATCCTTACTACACTTGCTGAAAC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GTAACTCTCCCCTTCCATTGTAG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GTAACTCTCCCCTTCCATTGTAG | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.413 | 0.404 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GTAACTCTCCCCTTCCATTGTAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.510 | 0.097 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CTACAATGGAAGGGGAGAGTTAC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.512 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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