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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 18:55:09, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

BES_z57N4_F IGS-SCF-0106 Bvu-KWS2320 BAC library Beta vulgaris subsp. vulgaris genomic clone z57N4, genomic survey sequence.
KG031262.1:809-830
AAGGAAAGTTTCTGATGTATTATGCAGTGT809GTAATTTGGTGAATGGTGATTGTCCCCGATTTTACTTGCAGTTTTACTTTGG
Beta vulgaris subsp. vulgaris genome assembly, chromosome: 1.
OX392547.1:6851373-6851394
AAGGAAAGTTTCTGATGTATTATGCAGTGT6851373GTAATTTGGTGAATGGTGATTGTCCCCGATTTTACTTGCAGTTTTACTTTGG
Beta vulgaris subsp. vulgaris genome assembly, chromosome: 1.
OX392556.1:7044625-7044646
AAGGAAAGTTTCTGATGTATTATGCAGTGT7044625GTAATTTGGTGAATGGTGATTGTCCCCGATTTTACTTGCAGTTTTACTTTGG
Polyommatus iphigenia genome assembly, chromosome: Z.
OY730178.1:8316681-8316702
ATACAAAAGTCCTGTTTGATTCACACGAGC8316681GTAATTTGGTGAATGGTGATTGGTGAGTCATGATTTGTAAGAAAAAAATTTA
TSA: Beta vulgaris Locus_3703_Transcript_1/4_Confidence_0.375_Length_835 mRNA sequence.
JP493207.1:81-102
CCAAAGTAAAACTGCAAGTAAAATCGGGGA81CAATCACCATTCACCAAATTACACACTGCATAATACATCAGAAACTTTCCTT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GTAATTTGGTGAATGGTGATTG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GTAATTTGGTGAATGGTGATTG | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.210 | 0.201 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GTAATTTGGTGAATGGTGATTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.299 | 0.090 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CAATCACCATTCACCAAATTAC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=46
0.300 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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