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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 14:20:25, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

KS21016O23 KS21 Capsicum annuum cDNA, mRNA sequence.
GD100715.1:142-161
GCTTGATTTGTGAGTGATTGTGCTAATTGA142GTAGCGTTTGTTCCCGTTGTGACGACCCTCTAGTCCTCTGTTAAGTTATG
KS21030B09 KS21 Capsicum annuum cDNA, mRNA sequence.
GD101906.1:142-161
GCTTGATTTGTGAGTGATTGTGCTAATTGA142GTAGCGTTTGTTCCCGTTGTGACGACCCTCTAGTCCTCTGTTAAGTTATG
TSA: Capsicum annuum MGMT_Contig39937 mRNA sequence.
JW090181.1:266-285
GCTTGATTTGTGAGTGATTGTGCTAATTGA266GTAGCGTTTGTTCCCGTTGTGACGACCCTCTAGTCCTCTGTTAAGTTATG
Capsicum annuum cultivar G1-36576 isolate CaT2T chromosome 3.
CP124729.1:36232945-36232964
GCTTGATTTGTGAGTGATTGTGCTAATTGA36232945GTAGCGTTTGTTCCCGTTGTGACGACCCTCTAGTCCTCTGTTAAGTTATG
Capsicum annuum Takanotsume DNA, chromosome 3, sequence.
AP026698.1:255068193-255068212
CATAACTTAACAGAGGACTAGAGGGTCGTC255068193ACAACGGGAACAAACGCTACTCAATTAGCACAATCACTCACAAATCAAGC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GTAGCGTTTGTTCCCGTTGT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GTAGCGTTTGTTCCCGTTGT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.297 | 0.288 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GTAGCGTTTGTTCCCGTTGT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.349 | 0.052 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ACAACGGGAACAAACGCTAC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=46
0.350 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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