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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 14:29:41, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

TL020E11 Young leaf cDNA library of tea plant (Camellia sinensis) Camellia sinensis cDNA clone TL020E11 5', mRNA sequence.
CV014397.1:341-360
GCCAATGTGCTGGGTGTTATCAAGCTTGAA341GTCCCCATTGCTCTTAGTTTGGTCATTAATGGGTGTGGAAAGAATGTTCC
TSA: Camellia sinensis tea_c7906 mRNA sequence.
KA287289.1:304-323
GCCAATGTGCTGGGTGTTATCAAGCTTGAA304GTCCCCATTGCTCTTAGTTTGGTCATTAATGGGTGTGGAAAGAAGGTTCC
ESTFullTSD1_73 ESTFullTSD1 Camellia sinensis var. assamica cDNA clone A193 5', mRNA sequence.
GH709627.1:261-280
GGAACCTTCTTTCCACACCCATTGATGACC261AAACTAAGAGCAATGGGGACTTCAAGCTTGATAACACCCAGCACATTGGC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GTCCCCATTGCTCTTAGTTT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GTCCCCATTGCTCTTAGTTT | format : html | download : | debug : 

0.008 | 0.008 | search_start;
0.266 | 0.258 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GTCCCCATTGCTCTTAGTTT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.442 | 0.175 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AAACTAAGAGCAATGGGGAC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.443 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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