GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-12-17 01:37:38, GGGenome : DDBJ release 138.0 (Jun, 2025)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Halorhabdus sp. CBA1104 chromosome, complete genome.
CP033878.1:2359632-2359651
GGCAACACAGTTCTTGTATTGGTTTTGTTA2359632GTAGAATCGCGGAAAACGACACGAGCACTGTAGCAAGGGAGTGTCGATTT
Ferdinandea cuprea genome assembly, chromosome: 2.
OY754959.1:17445084-17445103
AATTGGTAAGACAACTATTACTTTGGGTAA17445084GTAGAATCGCGGAAAACGACGTTCGTTCTGTCGCAATCCATGGTAGATAC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GTCGTTTTCCGCGATTCTAC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GTCGTTTTCCGCGATTCTAC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.226 | 0.217 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50800/match?q=GTCGTTTTCCGCGATTCTAC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.307 | 0.081 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50800/match?q=GTAGAATCGCGGAAAACGAC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.309 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).