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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2025-04-03 12:14:31, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

KBrH089E10R Brassica rapa BAC library KBrH Brassica rapa genomic clone KBrH089E10, genomic survey sequence.
DU114063.1:700-719
CTCTCTCTCTCTCTATATGTTTGTTTACGT700AGATACCCTCACTGATGCACGACGGGTAAATGAGCTTGTGAGGGTATTAT
KBrH044B19F KBrH, Brassica rapa HindIII BAC library Brassica rapa subsp. pekinensis genomic clone KBrH044B19, genomic survey sequence.
DX908400.1:805-824
CTCTCTCTCTCTCTATATGTTTGTTTACGT805AGATACCCTCACTGATGCACGACGGGTAAATGAGCTTGTGAGGGTATTAT
Brassica rapa subsp. pekinensis cultivar Inbred line 'Chiifu' clone KBrH023N19, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***, 2 ordered pieces.
AC241111.1:69597-69616
CTCTCTCTCTCTCTATATGTTTGTTTACGT69597AGATACCCTCACTGATGCACGACGGGTAAATGAGCTTGTGAGGGTATTAT
Brassica napus cultivar Xiang5A chromosome 3.
CP123878.1:27398155-27398174
CTCTCTCTCTCTCTATATGTTTGTTTACGT27398155AGATACCCTCACTGATGCACGACGGGTAAATGAGCTTGTGAGGGTATTAT
Brassica napus genome assembly, chromosome: A03.
HG994357.1:27419129-27419148
CTCTCTCTCTCTCTCTCTGTTTGTTTACGT27419129AGATACCCTCACTGATGCACGACGGGTAAATGAGCTTGTGAGGGTATTAT
Brassica rapa genome, scaffold: A03.
LR031572.1:27287276-27287295
CTCTCTCTTTCTCTTTATGTTTGTTTACGT27287276AGATACCCTCACTGATGCACTACGGGTAAATGAGCTTGTGAGGGTATTAT
Brassica rapa genome assembly, chromosome: A03.
LS974619.2:27414383-27414402
CTCTCTCTTTCTCTTTATGTTTGTTTACGT27414383AGATACCCTCACTGATGCACTACGGGTAAATGAGCTTGTGAGGGTATTAT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GTGCATCAGTGAGGGTATCT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GTGCATCAGTGAGGGTATCT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.343 | 0.334 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GTGCATCAGTGAGGGTATCT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.497 | 0.155 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AGATACCCTCACTGATGCAC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.502 | 0.005 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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