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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2026-03-08 11:49:02, GGGenome : DDBJ release 139.0 (Sep, 2025)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Porphyra yezoensis cDNA clone:PL032b10_r, 5' end.
AV431225.1:93-112
TGGACGAGGACCGGTGGCGCTCGCGACGGT93GTGCCACTAACGAACGTGTGGGCCCTCCCTGTCGGTGGAAGTGAGAAGGC
Eutreptiella sp. 'Long Island Sound 2002' genome assembly, chromosome: 24.
OZ038401.1:31601965-31601984
GGCGCCGTGCTGTATACCTACAGCAAAGTG31601965CACACGTTCGTTAGTGGCACTCCGTCCGAGTCTGCTCTGGGCTGCGGGCA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GTGCCACTAACGAACGTGTG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GTGCCACTAACGAACGTGTG | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.236 | 0.226 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50900/match?q=GTGCCACTAACGAACGTGTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.374 | 0.138 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50900/match?q=CACACGTTCGTTAGTGGCAC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.375 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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