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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 11:51:48, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Quercus dentata isolate Qdleaves-2020 chromosome 4.
CP116447.1:26615392-26615412
TAGCAAATCCTGCCAACCAAGCACCATTCT26615392TGTCTCTGATAATTCCACCACCACCCACTAATCCTAGGTTACCCATAGCTG
Quercus variabilis isolate HB chromosome 4b.
CP129436.1:23745407-23745427
TAGCAAATCCTGCCAACCAAGCACTATTCT23745407TGTCTCTGATAATTCCACCACCACCCGTTAATCTTGGGTTACCTATAGCTA
Chorisops tibialis genome assembly, chromosome: 1.
OY770262.1:312419305-312419325
TCGGGAGATCTTTTCAGCATACTCCTGGAC312419305TGTCTCTGATAATTCCACCACTTCCACGATTATTTTCTGCTGTCTCCTACC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GTGGTGGAATTATCAGAGACA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GTGGTGGAATTATCAGAGACA | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.185 | 0.176 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GTGGTGGAATTATCAGAGACA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.283 | 0.098 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGTCTCTGATAATTCCACCAC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.286 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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