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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2025-04-03 13:01:35, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Lotus japonicus DNA, clone:LjB18b20_f.
AG229470.1:190-209
TGTGGCATCCTTCCAATACATTAACTAATA190GTGGTTTTAATCGCAACAAGTTTTTGTGATAGTTAAAAATTGTCGCTGAT
Lotus japonicus B-129 DNA, chromosome 1, complete sequence.
AP022629.1:136184669-136184688
TGTGGCATCCTTCCAATACATTAACTAATA136184669GTGGTTTTAATCGCAACAAGTTTTTGTGATAGTTAAAAATTGTCGCTGAT
Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 1, clone: LjB18B20, BM1229.
AP007915.2:81971-81990
ATCAGCGACAATTTTTAACTATCACAAAAA81971CTTGTTGCGATTAAAACCACTATTAGTTAATGTATTGGAAGGATGCCACA
Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 1, clone: LjT17N03, TM1636.
AP008189.2:54523-54542
ATCAGCGACAATTTTTAACTATCACAAAAA54523CTTGTTGCGATTAAAACCACTATTAGTTAATGTATTGGAAGGATGCCACA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GTGGTTTTAATCGCAACAAG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GTGGTTTTAATCGCAACAAG | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.149 | 0.140 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GTGGTTTTAATCGCAACAAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.236 | 0.087 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CTTGTTGCGATTAAAACCAC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.237 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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