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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 18:39:33, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Yponomeuta plumbellus genome assembly, chromosome: 8.
OX371199.1:12634573-12634591
AAGTGTGCACTCAACTGTTCAGTTTCTATC12634573GTTCAAGGGAGGTTGAACTACAAAGATTCACATTACAGTTTGTTCCAAC
Caprimulgus europaeus genome assembly, chromosome: 5.
OU015528.1:2568786-2568804
ACAGCCTTGATTTCAAAGCTGAACAAACCC2568786AGTTCAACCTCCCTTGAACCATGTCGTGCACTGCAGCCTTCTAACCATC
Apeira syringaria genome assembly, chromosome: 11.
OW203665.1:19768514-19768532
TCTTTTATATATGTTTAACGATGTGATTAG19768514AGTTCAACCTCCCTTGAACGGGGAACACAACACTACGGTGCACAACTCG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GTTCAAGGGAGGTTGAACT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GTTCAAGGGAGGTTGAACT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.159 | 0.150 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GTTCAAGGGAGGTTGAACT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.253 | 0.095 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AGTTCAACCTCCCTTGAAC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.255 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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