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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 18:23:55, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Daucus carota subsp. sativus cultivar DH1 chromosome 7.
CP093349.1:12506963-12506983
TACCAAACATATACAACTCAACAGGAATGA12506963GAGTAATACCAAGTTACCAACTCCTTTCTTATGACATAAGAAAGCGAATTC
Beta vulgaris subsp. vulgaris genome assembly, chromosome: 4.
OX392550.1:39407176-39407196
AAAAGTGAACTATGTAACCACAGGAGAAGA39407176GAGTAATACCAAGTTACCAACCTTTGGCGCTCTAATATAATGAGGTCTTCA
Beta vulgaris subsp. vulgaris genome assembly, chromosome: 4.
OX392559.1:32273523-32273543
AAAAGTGAACTATGTAACCACAGGAGAAGA32273523GAGTAATACCAAGTTACCAACCTTTGGCGCTCTAATATAATGAGGTCTTCA
Ochropacha duplaris genome assembly, chromosome: 5.
OX592695.1:2057890-2057910
TGGAGGTGGTCAGTAGGAATGGCGCCAGAC2057890GAGTAATACCAAGTTACCAACTCGAACACTGTGTTATGGTTTCCTCACCAT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GTTGGTAACTTGGTATTACTC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GTTGGTAACTTGGTATTACTC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.325 | 0.316 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GTTGGTAACTTGGTATTACTC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.436 | 0.112 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GAGTAATACCAAGTTACCAAC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.439 | 0.003 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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