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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 12:26:47, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Capsicum annuum Takanotsume DNA, chromosome 9, sequence.
AP026704.1:257360686-257360709
AACCATACATTTCCTCACGAGTCCGGCACT257360686TAAAGGGATTCATTTTATGCATACTGAGAGATTTAGCTTTTCTAGCACGTAAAT
Capsicum annuum Takanotsume DNA, chromosome 9, sequence.
AP026704.1:263464658-263464681
AATTAAACATTTCCACAGGAGTCCAGCATT263464658TAAAGGGATTCATTTTATGCATACTGAGAGATTTAGCTTTTCTTGCATGTAAAT
TSA: Capsicum annuum MGMT_Contig38721 mRNA sequence.
JW088965.1:1737-1760
ATTTACATGCAAGAAAAGCTAAATCTCTCA1737GTATGCATAAAATGAATCCCTTTAAATGCTGGACTCCTGCGGAAATGTTTAATT
TSA: Capsicum annuum CM_MegaContig_40603 mRNA sequence.
JW107679.1:1325-1348
ATTTACATGCAAGAAAAGCTAAATCTCTCA1325GTATGCATAAAATGAATCCCTTTAAATGCTGGACTCCTGCGGAAATGTTTAATT
Capsicum annuum cultivar G1-36576 isolate CaT2T chromosome 9.
CP124723.1:2721143-2721166
ATTTACATGCAAGAAAAGCTAAATCTCTCA2721143GTATGCATAAAATGAATCCCTTTAAATGCTGGACTCCTGTGGAAATGTTTAATT
Capsicum annuum cultivar G1-36576 isolate CaT2T chromosome 9.
CP124723.1:9338380-9338403
ATTTACGTGCTAGAAAAGCTAAATCTCTCA9338380GTATGCATAAAATGAATCCCTTTAAGTGCCGGACTCGTGAGGAAATGTATGGTT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TAAAGGGATTCATTTTATGCATAC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TAAAGGGATTCATTTTATGCATAC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.179 | 0.170 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TAAAGGGATTCATTTTATGCATAC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.297 | 0.118 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GTATGCATAAAATGAATCCCTTTA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.300 | 0.003 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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