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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 15:05:09, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Arachis hypogaea cultivar Shitouqi chromosome A01.
CP030983.1:98132926-98132945
AGAGGATAGGTAGAGGTTTACTGTCGCGCG98132926GACCCCACGTTCAGGAGTTAGCGTGTACTTCAAGCTGAATTAGGTTCAGA
Arachis hypogaea cultivar Shitouqi chromosome A03.
CP030985.1:30236145-30236164
GGTTTATAGGTAGAGGTTTACTGTCGCGCG30236145GACCCCACGTTCAGGAGTTAGCGTGTACTTCACGCCGAATTAGGTCCAGA
Pegoplata infirma genome assembly, chromosome: 3.
OY992538.1:177105493-177105512
TTTCCAACAAGCCCAAAAACAAAAAAATCG177105493GACCCCACGTTCAGGAGTTATCAATTGTACCCTACTACCCTCCAACCACC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TAACTCCTGAACGTGGGGTC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TAACTCCTGAACGTGGGGTC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.141 | 0.132 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TAACTCCTGAACGTGGGGTC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.212 | 0.071 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GACCCCACGTTCAGGAGTTA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.216 | 0.004 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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